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癌症全基因组重测序

癌症全基因组重测序(WGS)


全基因组测序(Whole Genome Sequencing, WGS)是利用高通量测序平台对人类不同个体或群体进行全基因组测序,并在个体或群体水平上,全面挖掘DNA水平的遗传变异,为筛选癌症驱动基因,研究癌症发病机理提供重要信息。

1.技术优势:CNVSV检测;病毒整合位点检测;非编码区突变检测;有效数据覆盖均一;测序周期短。

2.平台优势:HiSeq X Ten测序平台支持。

3.技术路线:

 


4.技术参数:

         • 样本要求

    样品类型:DNA样品;

    样品总量:≥1.0ug DNA(提取自新鲜及冻存样本);

 ≥1.5ug DNA(提取自FFPE样本);

    样品浓度:≥20 ng/ul

         • 捕获平台:Agilent SureSelect Kit

         • 测序平台:HiSeq X Ten

         • 测序策略:HiSeq PE150

         • 测序深度:肿瘤癌组织(50X),癌旁组织/血液样本(30X),遗传病(30~50X);

         • 数据量:1.8 Tb

         • 项目周期:48个自然日。



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